微生物肥料是不同于化肥、有機肥的一種新型肥料。它是一類以微生物生命活動及其產物導致農作物得到特定肥料效應的微生物活體制品。也就是說，含有具有特定功能的微生物，是微生物肥料產品的本質特征。

　　目前，我國微生物肥料產品分為農用微生物菌劑、生物有機肥和復合微生物肥料3類，其對應標準分別為GB20287-2006《農用微生物菌劑》、NY884-2012《生物有機肥》和NY/T798-2004《復合微生物肥料》。其中，農用微生物菌劑（簡稱菌劑，或通稱功能菌劑）按內含的微生物種類或功能特性細分為根瘤菌菌劑、固氮菌菌劑、解磷微生物菌劑、硅酸鹽微生物菌劑、光合細菌菌劑、有機物料腐熟劑、促生菌劑、菌根菌劑、生物修復菌劑等品種。

　　由于微生物的種類繁多、功能多樣，以致微生物肥料具有多樣化的功能。在農業行業標準NY/T1847-2010中，將微生物肥料功能歸納為提供或活化養分、產生促進作物生長活性物質、促進有機物料腐熟、改善農產品品質、增強作物抗逆性、改良和修復土壤等6個方面。就某一微生物肥料產品來說，它不可能同時具備以上列出的所有功能，以其中的1~2個功能為主。因此，應按照我們的目標要求，選用不同功能的微生物肥料產品，并注意其適用的作物與地域范圍，才能發揮出產品的功效與特點，實現它在我國農業可持續發展中的不可替代的作用。